Aufgabe des Fachausschusses Bodan-Rail ist die Koordinierung der langfristigen Verkehrsplanung im Bodenseeraum, unter Berücksichtigung der vorhandenen kurz- und mittelfristigen Angebotskonzepte. Auf der Grundlage der Netzgrafiken für die gesamte Bodenseeregion können vorhandene Schwachpunkte im Bereich der Infrastruktur ermittelt und Strategien zu einer angesichts der Mittelknappheit nur schrittweise möglichen Verbesserung entwickelt werden. Die Steuerungsgruppe sieht es ebenfalls als ihre Aufgabe an, Anstöße zur Realisierung kleinerer Infrastrukturprojekte und zur Lösung von Teilproblemen zu geben. Zudem begleitet der FA Bodan-Rail die Entwicklung von Kooperationen im Tarifbereich.
Grundlage ist das Konzept Bodan-Rail 2020, welches als Interreg II-Projekt bereits im Jahr 2001 die Grundlagen für eine internationale Verkehrsplanung im Grossraum Bodensee geschaffen und Vorschläge für ein markant verbessertes Angebot im Personen-Bahnverkehr gemacht hat.